Affymetrix推出18款芯片 用于全转录组分析
生物芯片旗舰公司Affymetrix近日推出了18种全新的芯片，适合模式生物及应用型研究生物的全转录组分析。这一系列名为Affymetrix® Gene 1.1 ST Array Strips的芯片是一种强大的工具，能让研究人员更全面地了解基因表达的整体变化。
模式生物及应用型研究生物是当今生命科学研究中增长最快的领域之一，随着新一代测序和全基因组关联研究的推动，这些生物的研究热度持续升温。Affymetrix® Gene 1.1 ST Array Strips系列目前有18个产品，覆盖拟南芥、水稻、斑马鱼、牛、猪、犬等物种。随着这些芯片的推出，Affymetrix为研究人员提供了全转录组分析的新选择，适合比较基因组研究、进化生物学研究、农作物改进以及人类疾病分子机制的阐释。
Gene 1.1 ST Array Strips是由Affymetrix与领先的研究人员共同开发的，提供了独特的芯片设计以及目前最高的探针覆盖度。探针分布在全长基因内，而不像其他芯片那样只有一个位于3’端的探针，因此能更全面更准确地了解整体基因表达。全转录组分析让研究人员能够检测某一基因的多个转录异构体，包括剪接变体、未加A的转录本，以及截短的转录本等。
波士顿儿童医院和哈佛医学院干细胞研究项目的负责人Leonard Zon和Yi Zhou评价道：“新的斑马鱼芯片设计是一个重大的更新。基因内容是基于来自Zv9、VEGA、RefSeq及EST的最新序列。利用了最新的探针选择和设计算法，包括所有外显子，代表了整个转录本和已知的剪接变体。该芯片包含了超过52,000个转录本序列，是过去的3倍。这种新设计有助于我们的基因表达研究，而不足微克的RNA起始量让我们能利用少量细胞或胚胎开展通路分析。转录组的全面覆盖将实现斑马鱼与哺乳动物之间的基因表达调控网络的比较研究。”
Gene 1.1 ST Array Strips是专为GeneAtlas系统开发的。GeneAtlas是第一款个人型台式芯片系统，能同时处理四个样品。GeneAtlas系统和array strips提供了一个经济实惠的解决方案，将卓越的性能、简化的流程与直观易用的软件相结合。
Affymetrix负责基因表达的副总裁Kevin Cannon表示：“因芯片的成本和复杂度，科学家们无法对模式生物进行全转录组分析。Affymetrix GeneAtlas平台是第一个完整的芯片系统，实现了经济、易用且快速的数据分析。GeneAtlas系统，再加上这18种模式生物的芯片，为科学家们提供了一个个性化的系统，最新的内容以及简单的数据分析工具。”
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