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安捷伦发布CGH+SNP癌症芯片和Cytogenomics软件用于癌症研究

来源:安捷伦科技 作者:佚名 责任编辑:admin 发表时间:2011-10-29 14:00 
核心提示:除了目录芯片,安捷伦还提供 SurePrint G3 CGH+SNP 癌症芯片简单定制的功能。通过安捷伦 eArray 在线设计工具,用户可在 65,000 个SNP探针以及 2800 万个预审的 CGH 探针中随意选择。

2011年10月11日,蒙特利尔安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日(10月11日)发布 SurePrint G3 CGH+SNP 癌症目录芯片,该款芯片能够在同一实验中检测出癌症组织样本中的拷贝数和中性拷贝变异,将极大地满足研究人员日益增长的此类需求。
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安捷伦发布芯片的同时还发布了 CytoGenomics 2.0 软件,该款软件用于支持对遗传学复杂的样本,例如血液类癌症样本进行 CGH+SNP 分析。

这款新型芯片是基于癌症 Cytogenomics 芯片协会的设计,连同安捷伦世界一流的 CGH+SNP 芯片与 ISCA 芯片一起,成为细胞遗传学研究中不可或缺的重要工具。

贝勒医学院人类分子遗传学教授 Marilyn M. Li 说道:“癌症遗传学领域迫切需要一个兼具 CGH 和 SNP 微阵列所有优势的平台。整合后的 CGH-SNP 平台能够检测基因组上中性拷贝数变异,拷贝数扩增、杂合性缺失以及在单核苷酸多态性(SNP)沙漠区域的拷贝数变异。包含 SNP 探针的CGH 微阵列,能够提高检测低比例嵌合现象的准确度,还有助于测定癌症基因组的倍体形式。基于SNP 探针提供的等位基因信息具有极其重要意义。例如,SNP 等位基因谱有助于区分哪些是真正的高亚二倍体,哪些是亚二倍体的复制,从而深入了解疾病演化。”

安捷伦基因组学高级营销总监 Kathleen Shelton 谈到:“多年来,我们的双色 CGH 芯片平台广泛用于癌症研究,发表的论文多达几百篇。我们非常自豪地推出这款芯片,它融入了中性拷贝数杂合性缺失(LOH) 分析功能,能够获得与拷贝数数据同等准确的结果,在同款芯片上实现了5-Mb 的 LOH 分辨率。”

安捷伦同时发布了 CytoGenomics 2.0 软件,芯片用户可免费获得,用于对 SurePrint CGH+SNP 癌症芯片实验得到的数据进行分析。CytoGenomics 2.0 软件采用新的算法,能够分析基因组复杂的样本(常见于拷贝数变异导致的癌症)、肿瘤异质性样本、肿瘤细胞和正常细胞的混合样本。

除了目录芯片,安捷伦还提供 SurePrint G3 CGH+SNP 癌症芯片简单定制的功能。通过安捷伦 eArray 在线设计工具,用户可在 65,000 个SNP探针以及 2800 万个预审的 CGH 探针中随意选择。

这些新产品进一步扩充了安捷伦种类齐全的基因组解决方案大军,包括 Bravo 自动化液体处理平台、新一代 SureScan 芯片扫描仪、各种试剂以及生物信息学软件。安捷伦还就世界一流的 SureSelect XT 靶向序列捕获系统为进行新一代测序提供完善的样品制备工作流程。

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